下设芒果研究中心、坚果研究中心、水果研究中心等10个研究机构。拥有3个国家级研究室、2个国家级综合试验站、2个国家引进国外智力成果示范推广基地、1个国际科技合作基地，建设有农业农村部亚热带果品蔬菜质量监督检验测试中心、农业部农产品质量安全风险评估实验室(南宁)、农业农村部亚热带果品蔬菜质量安全控制重点实验室、农业农村部亚热带水果贮藏保鲜加工技术科研试验基地、广西壮族自治区芒果产业绿色高效发展工程研究中心、广西亚热带水果加工工程技术研究中心等一批高起点的科研平台。科研实验大楼建筑总面积1.4万平方米，拥有国际先进水平的成套科研仪器设备。主办有《农业研究与应用》刊物。

　　全所现有职工279人，其中专业技术人员241人，博士7人，硕士142人，高级职称90人。先后获得国务院特殊津贴7人，第一批广西高层次人才认定D、E层次5人，广西优秀专家1人，广西有突出贡献科技人员2人，广西杰出工程师奖1人，国家现代农业产业技术体系岗位科学家1人及试验站站长2人，广西芒果产业创新团队首席专家1人，广西芒果产业团队采后技术与质量安全岗位专家1人，广西香蕉产业创新团队首席专家1人，广西特聘岗位专家1人，广西柑橘产业团队采后技术与质量安全岗位专家1人，柔性引进国内外知名专家30人。

　　建所以来，获科学技术奖励126项，其中获国家级奖项4个，获省部级一等奖3项(次)、二等奖14项(次)、三等奖32项(次);育成推广农作物新品种41个，其中选育出木薯GR891、GR911、桂热3号、4号、5号、10号，芒果桂热82号、120号，桂香龙眼，澳洲坚果桂热引3号，甘蔗桂热2号等一批优良品种(详情可登录http://www.gxrzs.com查询)。

　　广西南亚热带农业科学研究所：隶属于广西壮族自治区农业科学院，始建于1954年，是全额财政拨款事业单位，目前所内实施实行总部(南宁)十基地(龙州)的运行和管理模式。开办地址位于广西南宁市江南区吴圩镇光明南路34号，主要工作地和科研基地在广西崇左市龙州县彬桥乡彬桥街20号。广西南亚所目前占地面积6582.93亩，主要从事澳洲坚果、甘蔗、茶叶、蛋黄果、乌榄、油梨、木薯等热带亚热带作物引种试种、良种选育、丰产栽培研究，以及农产品加工研究、技术服务、科普教育等工作。

　　单位现有在职职工260名，其中事业在编职工192名。事业在编职工中，专业技术人员148人，高级职称40人，自主培养博士3人，自治区级各类专家39人。设置了13个稳定支持科研团队，4个创新团队，2支产业科技先锋队、6个产业服务团。牵头了成立广西坚果产业协会，拥有“农业部龙州热带作物农业科学观测综合实验站”和农业部首批“热作标准化生产示范园(坚果、辣木、香蕉)”、农业部“南亚热带名优作物基地”、蔗糖产业省部共建协同创新中心、南亚热带作物种质资源保存与创新利用中心、广西南亚热带农业科学研究所农业科技园区等40多个高水平科研平台，建设有热带亚热带优稀果树资源圃、茶树资源圃、薯类作物资源圃、甘蔗资源圃，收集保存有澳洲坚果、蛋黄果、龙眼、山黄皮、芒果、香蕉、苹婆、木奶果、菠萝、甘蔗、茶树、木薯、桄榔、葛根、辣木等4500多份野生种、野生近缘种、国内外名特优新品种及濒危经济植物种质资源，是目前国内收集和保存热带亚热带果树种质资源最丰富的单位之一。单位依托团队、平台及资源，与100多个市县、高校、企业合作，在全区建立了100多个种植科技示范基地和技术示范点。建所以来，承担各级项目300多项，获得各级科技成果奖项107项，获授权国家发明专利113项，发布各类论文和著作共计690篇(册)，发布实施各类标准40项，完成成果登记295多项，2016年至今转化成果共计51项。选育有国内澳洲坚果品种“桂热1号”、国内蛋黄果品种“仙桃1号”和“仙桃2号”，以及甘蔗、茶树、木薯、山黄皮、乌榄等多个作物新品种。其中澳洲坚果品种“桂热1号”是国审品种、地方政府主栽品种，目前已在全广西范围内进行大面积推广(详情可登录http://www.gxaas.net/front/143查询)。